Image Analysis Software Engineer

Charakterystyka oferty:

• Miejsce pracy: 100% zdalnie
• Start: 1.02.2025 (max. 30 dni okresu wypowiedzenia)
• Forma współpracy: B2B z ITFS
• Klient: branża medyczna
• Rekrutacja: 2 etapy

Zadania na stanowisku:

• Wsparcie w rozwoju platformy Fractal do analizy bioobrazów w dużej skali.
• Integracja i implementacja standardów otwartych, takich jak OME-Zarr, dla przechowywania i wizualizacji obrazów.
• Konwersja obrazów mikroskopowych do formatu OME-Zarr.
• Implementacja i optymalizacja zadań przetwarzania obrazów przy użyciu narzędzi takich jak Cellpose na CPU i GPU.
• Projektowanie elastycznej architektury zadań do przetwarzania na zapleczu obliczeniowym typu HPC.
• Optymalizacja procesów pod kątem wydajności i skalowalności.
• Tworzenie i udoskonalanie webowych interfejsów użytkownika (GUIs) do platformy

Kogo poszukujemy?

• Min. 4 lata doświadczenia
• Bardzo dobra znajomość języka Python, w tym narzędzi i frameworków wykorzystywanych w analizie danych naukowych.
• Znajomość narzędzi i metod inżynierii oprogramowania, w tym kontroli wersji (GitHub / GitLab), CI/CD, konteneryzacji oraz pakowania oprogramowania.
• Doświadczenie w projektowaniu skalowalnych rozwiązań z wykorzystaniem obliczeń wysokiej wydajności (HPC) lub środowisk chmurowych.
• Solidna znajomość matematyki, analizy danych oraz metodologii i narzędzi statystycznych.
• Wykształcenie wyższe w dziedzinie bioinformatyki, informatyki, matematyki lub pokrewnej
• Angielski na poziomie min. B2