Praca w IT

Python w Big Science: Klucz do innowacyjnych projektów

Software developer przy pracy na komputerze z językiem Python
fot. TStudious / Shutterstock.com

Projekty Big Science to przedsięwzięcia badawcze, które wymagają skoordynowanej współpracy naukowców, inżynierów i techników z różnych dziedzin. Obejmują one takie obszary jak m.in. fizyka wysokich energii, astronomia, medycyna czy inżynieria materiałowa, a ich celem jest rozwiązywanie skomplikowanych problemów naukowych, które przekraczają możliwości pojedynczych jednostek naukowych. Wymagają one skomplikowanych infrastruktur badawczych, takich jak akceleratory cząstek, synchrotrony, radioteleskopy czy zaawansowane systemy komputerowe. Jak i dlaczego język programowania Python sprawdza się w projektach Big Science?

Python w Big Science

W tym kontekście Python staje się nieocenionym narzędziem w Big Science, zapewniając elastyczność, szeroki ekosystem bibliotek oraz łatwość integracji z istniejącymi systemami. W S2Innovation Python jest wszechobecny. Każdy z naszych pracowników go zna, wykorzystujemy go w wielu projektach, takich jak backend (webowe oprogramowanie do zarządzania alarmami IC@MS), tworzenie interfejsów użytkownika (GUI) oraz systemy sterowania oparte na PyTango lub pyISPyB. Python oferuje dostęp do ogromnej liczby wysokiej jakości bibliotek, które znacznie ułatwiają pracę naukowcom. Kluczowe z nich to:

  1. NumPy i SciPy – do obliczeń numerycznych i naukowych,
  2. Pandas – do analizy danych,
  3. Matplotlib i Seaborn – do wizualizacji,
  4. TensorFlow i PyTorch – do uczenia maszynowego i sztucznej inteligencji.

Dzięki niemu realizujemy złożone zadania, zarówno w obszarze automatyzacji, jak i zarządzania zaawansowanym sprzętem badawczym. Regularnie uczestniczymy w konferencjach takich jak Europython i PyCon PL, co pozwala nam być na bieżąco z najnowszymi trendami w świecie Pythona.

Zdolność do szybkiego prototypowania

W badaniach naukowych istotna jest możliwość testowania różnych hipotez i rozwiązań w krótkim czasie. Python pozwala na szybkie tworzenie prototypów, co jest nieocenione w dynamicznie zmieniających się projektach badawczych, świetnie nadaje się do tego m.in. Jupyter Notebook.

Python jako podstawa tworzenia systemów sterowania – PyTango

PyTango to biblioteka napisana w Pythonie. Stanowi ona interfejs do systemu sterowania TANGO Controls, którego rdzeń jest stworzony w języku C++. Dzięki takiemu połączeniu, PyTango łączy w sobie najlepsze cechy obu technologii – wydajność i szybkość działania systemu napisanego w C++, a także prostotę i przyjazność w pisaniu kodu w Pythonie.

Dzięki wysokiej wydajności, zapewnianej przez C++ w warstwie bazowej, PyTango doskonale radzi sobie z intensywnymi operacjami, umożliwiając obsługę złożonych systemów sterowania w dużych, rozproszonych środowiskach badawczych. Jednocześnie Python jako język programowania oferuje programistom elastyczność i łatwość w rozbudowie funkcji oraz w automatyzacji zadań. Taka kombinacja pozwala na intuicyjne zarządzanie systemami sterowania i przyspiesza prace badawcze. A także umożliwia szybkie tworzenie prototypów, jednocześnie zachowując wysoki poziom wydajności. PyTango umożliwia tworzenie serwerów urządzeń (device servers), które mogą kontrolować różnorodne sprzęty – od prostych czujników po skomplikowane urządzenia badawcze. Dzięki możliwości integracji z różnymi narzędziami Pythonowymi, takimi jak Taurus do tworzenia graficznych interfejsów użytkownika, PyTango stanowi solidny fundament dla złożonych projektów badawczych. To wszystko sprawia, że PyTango jest zarówno wydajnym, jak i przyjaznym w użytkowaniu narzędziem dla zespołów pracujących w ramach BigScience.

Taurus – intuicyjne tworzenie graficznych interfejsów użytkownika

Taurus to framework oparty na Pythonie, zaprojektowany z myślą o łatwym budowaniu graficznych interfejsów użytkownika (GUI) dla systemów sterowania, takich jak TANGO Controls. Co istotne, Taurus rozszerza możliwości PyQt – popularnego narzędzia do tworzenia aplikacji desktopowych w Pythonie. Dzięki temu łączy w sobie elastyczność i funkcjonalność PyQt z dodatkowymi, dedykowanymi funkcjami obsługującymi połączenie z Tango Controls, które ułatwiają budowanie interaktywnych aplikacji do zarządzania i monitorowania urządzeń.

Jedną z głównych zalet Taurusa jest możliwość łatwej integracji z systemami sterowania, takimi jak TANGO. Dzięki gotowym komponentom i widżetom – suwakom, wykresom, wskaźnikom czy przyciskom – tworzenie aplikacji sterujących i monitorujących staje się szybkie i intuicyjne. Taurus umożliwia dynamiczne aktualizowanie danych z systemów sterowania. To jest kluczowe w dużych projektach badawczych, takich jak synchrotrony czy akceleratory cząstek, gdzie dane zmieniają się w czasie rzeczywistym. Dzięki temu użytkownicy mogą na bieżąco monitorować stan urządzeń, kontrolować parametry oraz reagować na zmiany w systemie. Korzystanie z PyQt w Taurusie umożliwia programistom pełne wykorzystanie mocy biblioteki Qt, co zapewnia profesjonalne i nowoczesne interfejsy, jednocześnie zachowując prostotę i elastyczność Pythona.

Taurus stanowi niezawodne narzędzie do szybkiego i efektywnego tworzenia zaawansowanych GUI w projektach Big Science.

Sardana – zarządzanie urządzeniami eksperymentalnymi i automatyzacja procesów w środowiskach naukowych

Sardana to projekt oparty na PyTango i Taurus, który doskonale ilustruje, jak pythonowe projekty mogą się rozwijać i ewoluować. Została stworzona z myślą o rozbudowanych infrastrukturach badawczych, takich jak synchrotrony, gdzie precyzyjne i skalowalne systemy sterowania są kluczowe do efektywnego zarządzania złożonymi urządzeniami. Projekt ten jest w pełni zintegrowany z TANGO Controls. Jego fundamenty opierają się na wydajności PyTango i elastyczności Taurus. To czyni go idealnym narzędziem do zaawansowanych operacji kontrolnych.

Sardana rozszerza możliwości PyTango i Taurus. Oferuje dodatkowe funkcje, takie jak obsługa sekwencji pomiarowych, zarządzanie akwizycją danych oraz sterowanie bardziej złożonymi procesami eksperymentalnymi. Obejmuje gotowy zestaw narzędzi, który pozwala na integrację różnych urządzeń badawczych i jednoczesne kontrolowanie wielu eksperymentów.

Co więcej, Sardana jest otwartoźródłowa tak samo jak PyTango i Taurus. A to sprzyja ciągłemu rozwojowi i dostosowywaniu istniejących komponentów, jak i tworzenie nowych dostosowanych do wyzwań badawczych przez społeczność naukowców i inżynierów. Jej rozwój oparty na Pythonie pokazuje, jak modularne, elastyczne projekty mogą być zbudowane na bazie istniejących narzędzi i stale rozwijane, by sprostać coraz bardziej skomplikowanym wymaganiom.

Wszechstronność Pythona

Python, oprócz swojej roli w dużych projektach badawczych, jest również powszechnie stosowany w mniejszych, codziennych zadaniach, które wspierają infrastrukturę Big Science. Dzięki swojej elastyczności i łatwości integracji, Python doskonale sprawdza się w wielu różnych kontekstach.

Na przykład, w wielu projektach Python jest wykorzystywany do analizy danych wynikowych, co pozwala na szybkie przetwarzanie dużych ilości informacji i generowanie wniosków z prowadzonych badań. Dodatkowo, jest stosowany w tworzeniu bloków PLC na podstawie danych z Excela, co znacząco ułatwia procesy związane z automatyzacją systemów sterowania. Rozwiązania oparte na Pythonie są również kluczowe w procesach związanych z automatycznym znajdowaniem błędów. Przykładem może być archiwizator bugów, który w sposób automatyczny wykrywa problemy w systemie i przyczynia się do szybszego rozwiązywania awarii.

Ekosystem narzędzi do przetwarzania dużych zbiorów danych

Big Science często wiąże się z przetwarzaniem ogromnych ilości danych, które wymagają zaawansowanych narzędzi do analizy. Python oferuje potężne biblioteki do pracy z dużymi zbiorami danych:

  1. Pandas – do manipulacji danymi w formacie tabelarycznym,
  2. Dask – umożliwia równoległe przetwarzanie danych, pozwalając na pracę z dużymi zestawami danych bez przekraczania limitów pamięci komputera,
  3. PySpark – integracja z Apache Spark, popularnym narzędziem do przetwarzania danych rozproszonych.

Te narzędzia pozwalają na analizę i przetwarzanie danych w sposób skalowalny, co jest kluczowe w projektach Big Science.

Wsparcie dla obliczeń równoległych i wielkoskalowych

Zaawansowane projekty naukowe często korzystają z klastrów obliczeniowych, chmury obliczeniowej oraz infrastruktur HPC (High-Performance Computing). Python oferuje doskonałe wsparcie dla obliczeń równoległych i wielkoskalowych dzięki bibliotekom, takim jak:

  1. Multiprocessing i Threading – do równoległego wykonywania procesów,
  2. MPI for Python (mpi4py) – do obliczeń rozproszonych na klastrach,
  3. Joblib – do łatwej paralelizacji obliczeń.

Dzięki temu Python sprawdza się w projektach wymagających ogromnej mocy obliczeniowej, jak symulacje naukowe czy przetwarzanie obrazów medycznych w ogromnej skali.

Zdolność do integracji z zaawansowanymi technologiami i frameworkami

Python jest bardzo elastyczny i łatwo integruje się z innymi językami i technologiami. Można go bez problemu używać w kombinacji z technologiami wymagającymi dużej wydajności, takimi jak C, C++ czy Fortran, co jest często konieczne w zaawansowanych projektach Big Science, gdzie niektóre algorytmy muszą być wyjątkowo wydajne.

  1. Cython i Numba – do przyspieszenia obliczeń w Pythonie za pomocą kompilacji kodu,
  2. F2Py – pozwala na integrację z kodem Fortrana, często używanego w obliczeniach naukowych.

Dzięki tej integracji Python łączy w sobie łatwość obsługi z wydajnością.

Przenośność i wsparcie dla pracy w chmurze

Wiele zaawansowanych projektów w Big Science korzysta z infrastruktury chmurowej do przechowywania i przetwarzania danych. Python ma znakomite wsparcie dla pracy w środowiskach chmurowych, takich jak:

  • AWS Lambda – do uruchamiania kodu w odpowiedzi na zdarzenia w chmurze,
  • Google Cloud i Microsoft Azure – oferują gotowe integracje do uruchamiania skryptów w Pythonie.

Dzięki temu Python świetnie sprawdza się w projektach rozproszonych i globalnych, gdzie infrastruktura chmurowa jest kluczowa.

Szerokie możliwości w dziedzinie wizualizacji danych

W zaawansowanych projektach naukowych, zwłaszcza w Big Science, wizualizacja danych jest kluczowa dla zrozumienia wyników eksperymentów i symulacji. Python dostarcza potężne narzędzia do wizualizacji danych, takie jak:

  1. Matplotlib i Seaborn – do tworzenia wykresów statystycznych i naukowych,
  2. Plotly i Bokeh – do interaktywnych wizualizacji.

Za pomocą tych bibliotek naukowcy mogą łatwo prezentować i analizować złożone dane, co jest kluczowe w badaniach nad dużymi zbiorami danych.

Wsparcie dla Open Science i replikowalności badań

Big Science często opiera się na otwartych badaniach, które muszą być łatwo powtarzalne i dostępne dla szerokiej społeczności. Python wspiera podejście Open Science dzięki narzędziom, takim jak Jupyter Notebooks, które pozwalają na dokumentowanie, dzielenie się i replikowanie eksperymentów. Badacze mogą łatwo publikować swoje analizy i kod, co sprzyja współpracy i transparentności.

Ogromna społeczność i wsparcie

Python posiada jedną z największych społeczności programistycznych na świecie. A to jest nieocenione przy rozwiązywaniu problemów w zaawansowanych projektach. Naukowcy mają dostęp do ogromnej ilości zasobów, forów, tutoriali oraz otwartego kodu, który mogą dostosować do swoich potrzeb. Taka społeczność wspiera szybki rozwój narzędzi i metodologii badawczych, co jest kluczowe w dynamicznych projektach Big Science.

AI wkracza w świat Big Science

Projekty badawcze w świecie Big Science również podążają z trendami panującymi w świecie IT. Sztuczna inteligencja zaczyna odgrywać istotną rolę w automatyzacji i przyspieszaniu różnych procesów. Dobrym przykładem jest projekt realizowany przez jednego z pracowników S2Innovation, w ramach którego zdecydował się na zastosowania dużych modeli językowych (LLM) do automatycznego generowania kodu systemów sterowania w środowisku TANGO Controls. Ta koncepcja ma na celu ułatwienie i przyspieszenie pracy programistów, którzy muszą tworzyć serwery urządzeń w skomplikowanych infrastrukturach badawczych.

Projekt generatora, poza częścią serwerową generującą kod, zawiera również prosty interfejs do interakcji z systemem. Użytkownik wprowadza dane dotyczące urządzenia, takie jak jego schemat, dokumentacja techniczna oraz kluczowe informacje o komunikacji i funkcjonalnościach. Na tej podstawie system generuje szczegółowy kod serwera urządzenia w oparciu o wybrany model LLM, taki jak GPT, Claude czy Gemini. Kluczowym elementem projektu jest technika Retrieval-Augmented Generation (RAG). Polega ona na wyszukiwaniu odpowiednich fragmentów dokumentacji, a następnie ich wykorzystaniu w procesie generowania kodu. Dzięki temu model nie przetwarza całego dokumentu, a jedynie wyselekcjonowane, najbardziej adekwatne fragmenty, co przyspiesza i precyzuje proces generowania kodu.

Python odgrywa kluczową rolę w realizacji tego projektu, oferując elastyczność i szeroki ekosystem narzędzi, które wspierają automatyzację procesów.

W projekcie wykorzystano biblioteki takie jak PyTango oraz framework LangChain, który ułatwia integrację z modelami językowymi i pomaga zarządzać promptami. Faiss, wektorowa baza danych, odpowiada za wyszukiwanie podobieństw w dokumentacji, umożliwiając precyzyjne dopasowanie generowanego kodu do specyfikacji urządzeń. Dzięki temu cały system działa wydajnie i pozwala programistom skupić się na wyższych poziomach abstrakcji, zamiast tworzyć kod od podstaw.

Wykorzystanie sztucznej inteligencji w automatyzacji procesów w Big Science staje się coraz bardziej powszechne. Projekty takie jak wyżej opisany, w którym LLM generują kod systemów sterowania, to tylko początek tego trendu. Python, dzięki swojej wszechstronności, będzie nadal kluczowym narzędziem w tego typu rozwiązaniach. Z zaciekawieniem spoglądamy w przyszłość, gdzie sztuczna inteligencja będzie odgrywać coraz większą rolę w wspieraniu nauki i inżynierii, automatyzacji procesów, które do tej pory wymagały znacznych nakładów pracy ludzkiej.

Python w Big Science. Rozwój języka i kompatybilność z najnowszymi trendami technologicznymi

Python nieustannie się rozwija. A to sprawia, że jego ekosystem dostosowuje się do najnowszych technologii i trendów w nauce oraz przemyśle. Dzięki aktywnemu wsparciu i rozwojowi narzędzi, Python pozostaje aktualnym językiem do realizacji zaawansowanych projektów badawczych, które wykorzystują najnowsze osiągnięcia technologiczne.

Python jest świetnym wyborem dla zaawansowanych projektów w dziedzinie Big Science. Dlaczego? Ze względu na swoją elastyczność, wsparcie dla zaawansowanych technologii i algorytmów, szeroki ekosystem narzędzi do przetwarzania danych, uczenia maszynowego, obliczeń wielkoskalowych, a także dostępność dla naukowców z różnych dziedzin. Dzięki swojej przenośności i wsparciu dla chmury, Python umożliwia prowadzenie globalnych i skalowalnych projektów naukowych, a jego ogromna społeczność zapewnia stały rozwój narzędzi i technologii.

Software developer

Software developer w S2Innovation z ponad 3-letnim doświadczeniem w IT, specjalizujący się w tworzeniu systemów sterowania dla instytutów naukowych. Zajmuje się full-stack developmentem, wykorzystując głównie takie technologie jak Python, React, C++, Docker czy też Kubernetes. Absolwent Informatyki Stosowanej na Wydziale Fizyki i Informatyki Stosowanej AGH. Prywatnie pasjonat elektroniki, astronomii oraz gry na pianinie.

Podobne artykuły